MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid B

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010541	TAA	2	6	21	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010541	T	7	7	940	946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010541	TTA	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010541	T	8	8	1075	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010541	TGGT	2	8	1103	1110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010541	ATT	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010541	A	6	6	1158	1163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010541	TCT	2	6	1211	1216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010541	GAGC	2	8	1221	1228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010541	ATC	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010541	TTATTT	2	12	1343	1354	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010541	GAT	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010541	GATT	2	8	2398	2405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010541	TGA	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010541	TA	3	6	7456	7461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010541	GCTAG	2	10	7488	7497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010541	TAG	2	6	7598	7603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010541	TAT	2	6	11847	11852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010541	A	7	7	11895	11901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010541	ACTGTA	2	12	12001	12012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010541	A	6	6	12085	12090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010541	GAG	2	6	12127	12132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010541	A	6	6	13631	13636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010541	AGAGA	2	10	14141	14150	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010541	AAT	2	6	14623	14628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010541	TAC	2	6	14642	14647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010541	A	8	8	14680	14687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010541	CAAA	2	8	14821	14828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010541	TAAA	2	8	14829	14836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010541	T	6	6	15392	15397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010541	CTAT	2	8	15420	15427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010541	TAAT	2	8	15469	15476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010541	AATA	2	8	15559	15566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010541	CAA	2	6	16498	16503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010541	GA	3	6	16591	16596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010541	TTG	2	6	16605	16610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010541	AC	3	6	17309	17314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010541	CAA	2	6	17321	17326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010541	CAA	2	6	17372	17377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010541	CAAT	2	8	18064	18071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010541	TCC	2	6	18990	18995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010541	CAA	2	6	19016	19021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010541	ATA	2	6	19102	19107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010541	GAA	2	6	19132	19137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010541	GTA	3	9	20292	20300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010541	A	6	6	20324	20329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010541	TAA	2	6	20367	20372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010541	TAC	2	6	20383	20388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010541	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010541	TTC	2	6	20415	20420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010541	TGA	2	6	20784	20789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010541	TTTA	2	8	21979	21986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010541	TAA	2	6	22007	22012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010541	T	6	6	22139	22144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010541	TAA	2	6	22148	22153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010541	AATT	2	8	22161	22168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010541	ATT	3	9	22166	22174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010541	TGT	2	6	22175	22180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010541	TCAA	2	8	22236	22243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.